Metaanalys av NAD(P)(H)-kvantifieringsresultat uppvisar variation mellan däggdjursvävnader Ⅱ

Jun 01, 2023

Effekten av vävnadsinsamling före mort kontra obduktion på NAD(P)(H)-nivåer.

Vi förutspådde att det kan finnas någon observerbar skillnad i NAD(P)(H) redoxtillstånd som är beroende av vävnadsskördningsprocedurer. För att svara på denna fråga undersökte vi effekten av vävnadsinsamlingsprocedurer före och efter slakt på NAD(P)(H) redoxstatus. För denna analys jämförde vi värden från råttlevervävnader med tanke på det större antalet studier som definierar deras offerprotokoll. När de avslöjades, angav alla granskade studier att vävnadsproverna hölls kalla och omedelbart extraherades på is eller frystes vid -80 grader före NAD(P)(H)-mätningar. Denna analys fastställde att det inte fanns någon signifikant skillnad i NAD plus koncentrationer i råttlever (Fig. 6a) mellan vävnader extraherade före eller efter dödshjälp. De rapporterade NADH-nivåerna i råttlever är dock signifikant högre i obduktionsprover (Fig. 6b). Inga skillnader i totala NAD(H)-nivåer (Fig. 6c) observerades men NAD plus/NADH-förhållandet var lägre i vävnader som samlats in efter dödshjälp (Fig. 6d), vilket överensstämmer med variationen i NADH-nivåer. NADP plus, NADPH och NADP plus/NADPH-förhållandet resulterar i råttlever grupperade efter tidpunkt för vävnadsskörd visas i tilläggsfigur 9; Det otillräckliga antalet obduktionsprov tillåter oss dock inte att tolka effekten av tidpunkten för vävnadsskörd på NADP(H)-nivåer. I muslever fanns det ingen skillnad mellan NAD plus-nivåer före och efter slakt, men antalet rapporterande studier var begränsande (Fig. 6e). NejNADH,NADP plus, ellerNADPHobduktionsdata imusleverfanns att jämföra.

Flavonoid (2)

Klicka här för att få Hebrs Cistanche


Diskussion

Många nyare studier har visat att NAD(P)(H)-reglering är avgörande för cellulär homeostas och redoxstatus. Data erhållna från gnagare har lett till studier som undersöker NAD plus-nivåer i humant blod, som en mindre invasiv indikator på NAD plus-nivåer i hela kroppen. Nyligen genomförda kliniska studier visade att NAD plus-nivåer reducerades i sjukdomstillstånd23,47 och förhöjda efter NAD plus boostingstrategier23,44,48,49. Vi utförde en metaanalys av alla studier publicerade mellan 1946 och 20 juni 2021, som innehöll kvantitativa data för NAD(P)(H)-nivåer hos däggdjursarter med särskilt fokus på möss, råttor och människor eftersom de representerar de mest studerade arter inom det biomedicinska området. Denna analys gjordes delvis för att bestämma den genomsnittliga standardnivån för NAD(P)(H)-koncentrationer i normala däggdjursvävnader givet den välkända variansen i dessa mått över studier. Vi hoppas att dessa data kan användas för att stimulera standardiserade protokoll inom området NAD plus forskning och för att främja användningen av NAD(P)(H)-nivåer och redoxkvoter som tillförlitliga biomarkörer för sjukdoms- och behandlingsregimer.

Trots avsevärd variation i mått mellan gnagarvävnader visade denna metaanalys liknande genomsnittliga NAD plus-nivåer över vävnader med några undantag. Intressant nog uppvisade musskelettmuskler lägre medianhalter av NAD plus (Fig. 2a) än andra mycket metaboliska vävnader (dvs lever, njure, hjärta och hjärna). Detta kan indikera olika NAD(H) redoxstatus i skelettmuskulaturen eller kan peka på större problem med metabolitextraktion i fibrösa vävnader. Dessa observationer kunde dock inte verifieras hos människor på grund av brist på provtagna vävnader bortom blod och muskler.

Flavonoid-1

Det finns många potentiella faktorer som kan påverka noggrannheten av fysiologiska NAD(P)(H)-mätningar i vävnadsprover. När de rapporterades beskrev alla studier vävnader som skördade och direkt nedsänkta i flytande kväve, eller hölls på is före frysning eller bearbetning för att bevara de värmekänsliga fraktionerna (NAD plus och NADP plus). Effekten av pH på de olika NAD(P)(H)-fraktionerna, såsom den syralabila naturen hos de reducerade NAD(P)H-formerna, har lett till användningen av pH-neutrala extraktionslösningsmedel i majoriteten av studierna . Men med tanke på den snabba omvandlingen av de reducerade och oxiderade metaboliterna och effekten av anoxi på NAD(H)50–53, är det också viktigt att säkerställa snabb extraktion av vävnadsmetaboliter och lämpliga procedurer för att släcka cellulär NAD(P)(H) )-redox/konsumtionsenzymer, såsom genom deproteinisering. I enlighet med dessa linjer indikerar vår analys av vävnadsinsamling före och efter slakt att analys efter slakt gynnar minskningen av NAD plus. Minskningen av vävnads-NAD plus har tidigare beskrivits in vivo i hjärnan, hjärtat och levern hos råttor som exponerats för en förlängd 2.{10}}h hypoxisk atmosfär54, en miljö som delvis kan recapituleras av långa perioder av post- offra vävnadsinsamling innan snäppfrysning. Detta kan indikera att extrahering av vävnader under narkos eller prioritering av den omedelbara skörden av vävnader som är avsedda att användas för metabolitanalys efter avlivning, bör ske för att få representativa NAD(P)(H)-mätningar.

Det finns också potential för olika kvantifieringsmetoder, som var och en har olika begränsningar, för att bidra till den övergripande variabiliteten inom studien av NAD(P)(H)-mätningar. Under de senaste två decennierna var de mest använda metoderna enzymcykelanalyser, LC–MS och HPLC. Var och en av dessa metoder påverkas av metabolitextraktionstekniker, kvantifieringsparametrar och genomförandet av korrekta kvalitetskontroller. Genom att använda LC–MS, Lu et al. har visat att omvandlingen mellan reducerade och oxiderade former av NAD(P)(H)-metaboliter sker i olika hastigheter i olika extraktionsbuffertar eller lösningsmedel med acetonitril:metanol:vatten med 0.1 M myrsyrablandning som ger högsta återhämtningen med minst interkonverteringar31. Men när man använder LC–MS kan denna interkonvertering övervakas mellan enskilda prover av en studie genom att spika med interna kontroller som NAD(P)(H)-isotoper, vilket är en fördel med LC–MS-tekniken jämfört med HPLC och enzym cykelanalyser31,33,55. Ändå, även med välkontrollerade LC–MS-tekniker, kan olika faktorer störa den uppmätta signalen, inklusive matriseffekter och variationer i joniseringseffektivitet. Till exempel använder vissa studier 13C-märkta jästextrakt som interna standarder i LC-MS-baserad metabolomik. Att spetsa den extraherade provets metabolitmatris med en 13C-märkt jästextraktmetabolitmatris kan dock få olika konsekvenser, såsom jonundertryckning, vilket minskar signalen från märkta och/eller omärkta metaboliter, och kan leda till fel i den absoluta kvantifieringen om inte. upptäckts genom en noggrann kvalitetsbedömning56. Även om LC-MS-tekniker teoretiskt tillåter mätning av flera NAD(P)(H)-metaboliter i ett experiment, finns det fortfarande begränsningar eftersom optimala utspädningar måste köras om metaboliterna av intresse har stora skillnader i koncentrationer. Trots deras fördelar jämfört med de enklare enzymcykelanalyserna, kräver komplexiteten hos LC-MS-metoder nödvändigheten av grundlig optimering. Nyligen har nya analytiska metoder, såsom NAD plus biosensorer och bildbaserad masspektrometri, utvecklats men det finns fortfarande otillräcklig kvantitativ data genererad från dessa tekniker för att inkluderas i en metaanalys. Även om en studie inkluderad i vår metaanalys använde en pappersbaserad bioluminescerande biosensor för att mäta NAD plus-nivåer i muslever och andra provtyper57. Denna studie inkluderades i gruppen för bioluminescensanalyser på grund av den liknande detektionsmetoden (Fig. 1a).


Flavonoid

För syftet med denna analys exkluderades data från 677 studier. Detta inkluderade studier som gav relativa NAD(P)(H)-resultat (51 procent ) snarare än kvantitativa, samt studier där NAD(P)(H) koncentrerasnormaliserades inte tillvävnadsvikt, proteininnehåll, ellerblod volym(13 procent). 36 procent av de exkluderade studierna utfördes på icke-lämpliga prover (t.ex. icke-däggdjurspersoner, cell- eller vävnadskulturer). Utöver de uteslutna studierna inkluderar stora begränsningar i denna metaanalys variationen av, eller bristen på rapporterad information relaterad till, föranalytiska procedurer (information om extraktion före eller efter slakt eller extraktionsbuffert) och/eller de analytiska metoderna, tillsammans med med ålder, kön, genetisk bakgrund, kost och matningsstatus vid offer för gnagare.
Även om vår metaanalys belyser variationen mellan studier och nödvändigheten av att standardisera NAD(P) (H) kvantitativa mätningar, bedömer eller diskuterar vår analys integiltigheten av de jämförande resultateninom en individuell studie. Med tanke på implikationerna av flera NAD(P)(H)-metaboliter som fungerar som biomarkörer förhälsa hos människor, standardiseringen eller grundlig studieoptimering av pre-analytiska ochanalytiska procedurerkommer att tillåtabättre jämförelser av resultat över studier. Detta blir ännu mer avgörande med en ökningantal kliniska studier som testar effekten av läkemedel eller kosttillskott som används för att ändra vävnads NAD(P)(H)-nivåer tillförbättra hälsan hos människor.

Flavonoid (11)

Metoder

Litteratursökning. "Epub Ahead of Print", "In-Process & Other Non-indexed Citations", "Versions", "PubMed-Not-MEDLINE", "Daily update", "Front segment Weekly Update", "Back flys from 1946 to start framtillsegment"-citat mellan 1946 och 20 juni 2021 i MEDLINE ALL (Ovid)-databasen söktes ochgranskats för artiklar som innehåller kvantitativa data om NAD(P)(H)-metabolitnivåer i däggdjursvävnader som utfodrad i bilaga S1. Sökfrågestrategin gav 3377 artiklar. En ytterligare blodfokuserad sökning varutfördes med samma databas och gav 1513 artiklar (bilaga S2).
Screeningmetodik. Sammanfattningar och titlar som rapporterar NAD(P)(H)-metabolitkvantifiering i däggdjursvävnader och blod genomgick fulltextscreening. Alla abstrakta recensioner verifierades med en andra recensionoch eventuella konflikter löstes. Efter den abstrakta screeningen valdes 643 publikationer ut för fulltextgranskning förden vävnadsfokuserade sökningen och 272 för den blodfokuserade sökningen (kompletterande fig. 10). Studier som endast preskickade relativa NAD(P)(H)-metabolitdata exkluderades under fulltextscreeningen, med undantag förstudier som rapporterar NADplus/NADH-förhållanden. Resultaten härrör enbart från tssues, celler, isolerade organeller bibehållsi media eller från blodeluent från perfusion uteslöts. Denna fulltextgranskning ledde till att 667 uteslöts(457 plus 210) artiklar främst på grund av bristen på NAD-metabolitdata (50,5 procent), data härledda från olämpligaprover (36,3 procent) eller data presenterade som relativa/godtyckliga enheter (13,2 procent). Slutligen ingick 241 artiklar iden kvalitativa metaanalysen och 205 i den kvantitativa metaanalysen (kompletterande fig. 10). Även om vårinitial sökning inkluderade studier publicerade från 1946 till 20 juni 2021. Som nämnts ovan, den äldsta studien medkvantitativa NAD(P)(H)-data som uppfyllde våra acceptanskriterier publicerades 1961


Dataextraktion.

Numeriska data för NAD(P)(H)-metaboliter erhölls antingen direkt från artiklarna eller extraherades från artikelfigurer med hjälp av en semi-automatisk dataextraktionsmjukvara (WebPlotDigitizer58). Dessutom, där så är tillämpligt, registrerades vävnadsprovtagningstidpunkterna i förhållande till offer och/eller vävnads-/blodprovsmetoder (dvs. metod för anestesi och/eller dödshjälp, vävnadshantering och lagringstemperatur). För djurmodeller registrerades arten, egenskaperna (t.ex. stam, genotyp, ålder och vikt) och miljöförhållanden (t.ex. sömncykel, typ av diet, matningsfrekvens och utfodringstillstånd i förhållande till vävnadsprovtagning). Dessutom, för alla studier, extraherades behandlingar (t.ex. farmakologiska behandlingar, operationer, bestrålning, tumörinduktion och andra förfaranden som tillämpas på försökspersonerna) och all studiegruppsinformation (t.ex. behandlings- eller sjukdomsgrupper och motsvarande kontroller). Slutligen, metoden för NAD(P)(H) kvantifieringsmetod (t.ex. enzymatiska analyser, masspektrometribaserade, HPLC, NMR, bioluminescens) och publikationsspecifikationer (dvs publikationstitel, referenskod [DOI, Medline UI, PMID] eller hyperlänk och utgivningsår) noterades (tilläggsmaterial 2).



Dataanalys. Före analys omvandlades alla koncentrationer till nmol/g vävnad eller nmol/g proteiner för vävnadsprover eller nmol/ml för blodfraktioner. På grund av det låga antalet resultat normaliserade till proteininnehåll visar vi endast resultat normaliserade till vävnadsvikt och blodvolym. Statistisk analys utfördes med GraphPad Prism version 9.3.1 (GraphPad Sofware Inc., San Diego, Kalifornien, USA,DatatillgänglighetAll data extraherad och analyserad under denna studie ingår i denna publicerade artikel och dess tillägginformation fles.Mottaget: 29 april 2022; Godkänd: 7 februari 2023



Referenser

1. Menzies, KJ, Zhang, H., Katsyuba, E. & Auwerx, J. Proteinacetylering i metabolism-metaboliter och kofaktorer. Nat. Rev. Endocrinol. 12, 43 (2016).
2. Chambon, P., Weill, JD, Doly, J., Strosser, MT & Mandel, P. Om bildandet av en ny adenylförening genom enzymatiska extrakt av leverkärnor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 25, 638-643 (1966).
3. Hassa, PO, Haenni, SS, Elser, M. & Hottiger, MO Nukleära ADP-ribosyleringsreaktioner i däggdjursceller: Var är vi idag och vart är vi på väg?. Microbiol. Mol. Biol. R 70, 789–829 (2006).
4. Takasawa, S., Nata, K., Yonekura, H. & Okamoto, H. Cyklisk ADP-ribos i insulinutsöndring från pankreatiska betaceller. Science 259, 370-373 (1993).
5. Wolf, IMA et al. Föregångare av T-cellsaktivering: Initiala, lokaliserade Ca2 plus-signaler medierade av NAADP och typ 1 ryanodinreceptorn. Sci. Signal. 8, ra102 (2015).
6. Malavasi, F. et al. Evolution och funktion av ADP Ribosyl cyclase/CD38 genfamiljen i fysiologi och patologi. Physiol. Upps. 88, 841–886 (2008).
7. Gasser, A., Bruhn, S. & Guse, AH Andra budbärarfunktionen av nikotinsyraadenindinukleotidfosfat avslöjad genom en förbättrad enzymatisk cyklingsanalys*. J. Biol. Chem. 281, 16906–16913 (2006).
8. Kulkarni, CA & Brookes, PS Cellulär avdelning och redox/icke-redox-funktionerna hos NAD plus. Antioxid. Redox Signal.31, 623–642 (2019).
9. Xiao, W., Wang, R.-S., Handy, DE & Loscalzo, J. NAD(H) och NADP(H) redoxpar och cellulär energimetabolism. Antioxid. Redoxsignal. 28, 251–272 (2018).

10. Love, NR et al. NAD-kinas kontrollerar djurs NADP-biosyntes och moduleras via evolutionärt divergerande kalmodulinberoende mekanismer. Proc. Natl. Acad. Sci. 112, 1386–1391 (2015).


Fråga för mer:

E-post:wallence.suen@wecistanche.com whatsapp: plus 86 15292862950









Du kanske också gillar